Analisis Bioinformatika Potensi Obat, Farmakokimia, Fisikokimia, dan Toksisitas Senyawa Chalepin dari Tanaman Obat Ruta angustifolia

Shafa Noer; Rifqi Pratama

doi:10.30998/edubiologia.v5i1.27368

Analisis Bioinformatika Potensi Obat, Farmakokimia, Fisikokimia, dan Toksisitas Senyawa Chalepin dari Tanaman Obat Ruta angustifolia

Shafa Noer^(1*), Rifqi Pratama⁽²⁾

(1) (Scopus ID: 57204545462, Sinta ID: 5979788) Universitas Indraprasta PGRI
(2) Universitas Indraprasta PGRI
(*) Corresponding Author

Abstract

Chalepin merupakan salah satu senyawa bioaktif yang terkandung dalam beberapa tanaman obat, termasuk tanaman Ruta angustifolia. Chalepin memiliki aktivitas biologi yang potensial sebagai agen terapeutik dan saat ini telah diteliti untuk mengatasi berbagai penyakit seperti kanker dan hepatitis. Dengan karakteristik yang begitu kuat, diperlukan analisis mendalam tentang sifat-sifat potensi obat dari senyawa ini termasuk sifat farmakokimia, fisikokimia dan toksisitasnya. Kemajuan teknologi saat ini dengan kehadiran ilmu bioinformatika memungkinkan menganalisis suatu senyawa dengan cara yang lebih cepat dan akurat serta menghemat biaya sehingga dapat lebih efektif digunakan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengevaluasi kelayakan chalepin sebagai kandidat obat potensial dengan pendekatan bioinformatika, sehingga dapat memberikan landasan bagi penelitian lebih lanjut dalam hal pengembangan senyawa ini sebagai bahan baku obat. Metode yang dipakai ialah penelitian eksperimental menggunakan pendekatan In-Silico. Hasil menunjukkan bahwa sifat farmakokimia dan fisikokimia senyawa ini secara umum dikategorikan berpotensi digunakan sebagai obat. Hasil prediksi sifat toksisitasnya menunjukan senyawa chalepin berada di kelas 4, yang artinya dapat berbahaya jika ditelan, dengan LD₅₀ 1500mg/kg. Hal ini menunjukkan bahwa untuk menerapkan senyawa ini sebagai obat, diperlukan dosis yang tepat agar tidak menimbulkan efek samping dalam tubuh manusia.

Keywords

Chalepin; Bioinformatika; Farmakokinetik; Fisikokimia; Toksisitas

Full Text:

PDF (Indonesian)

References

Banerjee, P., Kemmler, E., Dunkel, M. R. P. (2024). ProTox 3.0: a webserver for the prediction of toxicity of chemicals. Nucleic Acids Research, 52, W513W520.

Daina, A., Michielin, O., & Zoete, V. (2014). iLOGP: A simple, robust, and efficient description of n?octanol/ water partition coefficient for drug design using the GB/SA approach. Journal of Chemical Information and Modeling, 2014, A-R.

Daina, A., Michielin, O., & Zoete, V. (2017). SwissADME: A free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7(January), 113. https://doi.org/10.1038/srep42717

Daina, A., & Zoete, V. (2016). A BOILED-Egg to predict gastrointestinal absorption and brain penetration of small molecules. Chem Med Chem, 11171121. https://doi.org/10.1002/cmdc.201600182

Fakai, M. I., Abd Malek, S. N., & Karsani, S. A. (2019). Induction of apoptosis by chalepin through phosphatidylserine externalisations and DNA fragmentation in breast cancer cells (MCF7). Life Sciences, 220, 186193. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2019.01.029

Fakai, M. I., Karsani, S. A., & Malek, S. N. A. (2017). Chalepin and rutamarin isolated from Ruta angustifolia inhibit cell growth in selected cancer cell lines (MCF7, MDA-MB-231, HT29, and HCT116). Journal of Information System and Technology Management, 5(2).

Lipinski, C. A., Lombardo, F., Dominy, B. W., & Feeney, P. J. (2012). Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. Advanced Drug Delivery Reviews, 64(SUPPL.), 417. https://doi.org/10.1016/j.addr.2012.09.019

Nahar, L., Al-Majmaie, S., Al-Groshi, A., Rasul, A., & Sarker, S. D. (2021). Chalepin and chalepensin: Occurrence, biosynthesis and therapeutic potential. Molecules, 26(6). https://doi.org/10.3390/molecules26061609

Noer, S., Abinawanto, Bachtiar, B. M., Bowolaksono, A., & Fajriah, S. (2022). Candida albicans and Streptococcus mutans biofilms suppression by bioactive compounds isolated from Ruta angustifolia. Journal of Hunan University Natural Sciences, 49(1), 196204. https://doi.org/10.55463/issn.1674-2974.49.1.25

OBoyle, N. M. (2012). Towards a universal SMILES representation - a standard method to generate canonical SMILES based on the InChI. Journal of Cheminformatics, 4(9), 1. https://doi.org/10.1186/1758-2946-4-22

Banerjee, P., Kemmler, E., & Dunkel, M. R. P. (2024). ProTox 3.0: a webserver for the prediction of toxicity of chemicals. 52, W513W520.

Richardson, J. S. M., Aminudin, N., & Malek, S. N. A. (2017). Chalepin: A compound from Ruta angustifolia L. pers exhibits cell cycle arrest at S phase, suppresses nuclear factor-kappa B (NF-?B) pathway, signal transducer and activation of transcription 3 (STAT3) phosphorylation and extrinsic apoptotic pathway in non-small cell lung cancer carcinoma (A549). Pharmacognosy Magazine, 13(51), S489S498. https://doi.org/10.4103/pm.pm_13_17

Richardson, J. S. M., Sethi, G., Lee, G. S., & Malek, S. N. A. (2016). Chalepin: lsolated from Ruta angustifolia L. Pers induces mitochondrial mediated apoptosis in lung carcinoma cells. BMC Complementary and Alternative Medicine, 16(1). https://doi.org/10.1186/s12906-016-1368-6

Siddharthan, N., Raja Prabu, M., & Sivasankari, B. (2016). Bioinformatics in Drug Discovery a Revi. International Journal of Research in Arts and Science, 2(2), 1113. https://doi.org/10.9756/ijras.8099

Wahyuni, T. S., Widyawaruyanti, A., Lusida, M. I., Fuad, A., Soetjipto, Fuchino, H., Kawahara, N., Hayashi, Y., Aoki, C., & Hotta, H. (2014). Inhibition of hepatitis C virus replication by chalepin and pseudane IX isolated from Ruta angustifolia leaves. Fitoterapia, 99, 276283. https://doi.org/10.1016/j.fitote.2014.10.011

DOI: http://dx.doi.org/10.30998/edubiologia.v5i1.27368